Проект "Токийские братья-пришельцы" основан на произведении Синдзо Кэйго. Этот автор представил одну из лучших черно-белых манг за всю свою карьеру. Его рассказ лёг в основу сериала. В центре внимания сюжета оказывается Фуюноске, молодой человек, который выглядит, как любой другой студент, проживающий в Токио. Столичные приключения главного героя оборачиваются встречей с неземным существом. Правда, как оказалось, нежданный гость - это брат главного персонажа, о котором тот ничего не знал. Как оказалось, Фуюноске тоже пришелец, как и Натсутаро. На Земле главные действующие лица оказываются неслучайно - у них секретная задача по изучению поведения людей и исследованию неизвестного инопланетянам вида. Теперь Фуюноске задумывается о том, как для брата отыскать работу, чтобы отвести от него подозрения.