Вторая Мировая Война подошла к концу. Командование союзников занимается обеспечением мирового порядка. В Японии создаётся особое агентство, отделение, которое противостоит терроризму. Их цель – сделать тихоокеанский регион максимально безопасным и не позволить террористам заниматься здесь своей деятельностью. Организация получилась крайне необычная, ведь в состав вошли ниндзя! Когда-то эти люди занимались исключительно внутрияпонскими делами, однако теперь вышли за пределы своей страны. Программа продолжает развиваться. Порядка двадцати тысяч сотрудников-ниндзя заботятся о безопасности. Правда, среди них есть и крайне неопытные зелёные новички. Среди них и Куро, семнадцатилетний пацанчик, типичный неудачник, которому лишь предстоит доказать свою состоятельность. Он неожиданно находит след жестокого иностранного картеля, который своими агентами буквально заполонил Токио.