Проект "Звездный флаг" является идейным продолжателем сюжетной линии аниме "Звездный Герб". Проект продолжает рассказ о войне, которая развернулась между империей людей АВ и сторонниками свободы и равноправия из Объединения Человечества. Каждый новый день - новые боевые события, которые могут перевернуть ход войны в пользу одной из сторон. Исход этого противостояния непредсказуем, однако на стороне каждой из противоборствующих сторон есть свои герои. Лафир получает под управление выдающийся летательный аппарат, когда Джинто решает стать элементом поддержки для этого корабля.