Действие разворачивается спустя некоторое время после событий, описанных в первой части фильма. Земля очень сильно изменилась с тех пор, и явным доказательством этому является то, что люди уже далеко не единственные хозяева планеты. Численность генетически модифицированных обезьян, во главе которых стоит хитроумный Цезарь, увеличивается с каждым днем. Единственной угрозой для их существования остаются колонии людей, которым все же удалось выжить после ужасной эпидемии так называемого «Обезьяньего гриппа». Цезарь делает все возможное, чтобы сохранить свой народ, и что самое главное перемирие выгодно обеим сторонам. Вот только пока большая часть уцелевшего человечества сосредоточена на выживании, некоторые ученые продолжают искать способ уничтожить обезьян…