Фильм «Гоемон» (Goemon) показывает жизнь в Японии 17 века, когда вся страна была под властью тайных властителей. Именно в это время разворачивается настоящая борьба между великим ниндзя и мастером ниндзюцу. Противостоять злодею оказалось слишком сложно, и в этом бою отец Гоемона был побежден: мастер и его жена были жестоко убиты. Но их сыну удалось спрятаться и впоследствии, взявший его под опеку Ода Нобунага, обучил его всему, что знал сам. Вместе со своим лучшим другом Киригакурэ они обучались тонкостям восточных единоборств и стали одними из лучших среди ниндзя. Но мальчики выросли и их пути разошлись: Гоемон стал настоящим защитником слабых, справедливым ниндзя, который боролся с преступностью и беззаконием. Главный герой стал настоящей легендой среди простых людей, которые принимали его за своего. Но вскоре любимый учитель Гоемона был убит Тоетоми Хидеоси и верный ученик, который не может остаться в стороне, решает найти своего злейшего врага и отомстить за смерть учителя. Но в этой борьбе ему придется пойти против лучшего друга – Киригукурэ, который в отличие от главного героя, пошел по пути зла и быстрого достижения своих целей любыми путями.