Отважный и доблестный Керк вместе со своей командой благополучно возвращается домой на космическом судне после опасного путешествия на Вулкан. Но экипаж не перестает покидать нехорошее предчувствие грядущей опасности. Несмотря на то, что они успешно спасли целого и невредимого живого Спока, ребята не спешат сильно радоваться, вспоминая все поступки, которые им пришлось совершить вопреки своей совести, честности и человечности. Они изначально не подчинялись приказам главнокомандующих, угнали «Энтерпрайз», поэтому со страхом ожидают реакции на свое возвращение. Но, как выяснилось, самое страшное заключалось отнюдь не в этом. На нашу планету прибыл большой и подозрительный корабль, посылающий сигналы на языке вымерших китов. Это конструкция неизвестных создателей обладала способностью влиять на погодные условия, поэтому с легкостью вызывала ливневые дожди и смертоносные грозы. Появилось предположение, что в скором времени Земля снова окажется заселена китообразными существами, которые урегулируют возникающий конфликт и спасут ситуацию. Эту теорию поддерживают Керк и его друзья, которые готовы на свой страх и риск испытать на себе путешествие во времени. Тем самым они намереваются доставить китов в будущее, чтобы спасти человечество и находящуюся в опасности планету.Фильм получил четыре заслуженных номинации на премию «Оскар».